青岛海事局设置9个内设机构，3个处室办事机构，7个派出机构。
内设机构：指挥中心、监管一处、监管二处、监管三处、督察处、办公室、人事教育处、财务处、党群工作部（组织部）；
处室办事机构：船舶交通管理中心、政务中心、海巡执法支队；
派出机构：大港海事处、前湾海事处、黄岛海事处、前海海事处、崂山海事处、即墨海事处、胶南海事处。
机构设置如下图：
